Лаборатория природно-очаговых вирусных инфекций | ФГБНУ «НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. Сомова» Роспотребнадзора

ЛАБОРАТОРИЯ ПРИРОДНО-ОЧАГОВЫХ ВИРУСНЫХ ИНФЕКЦИЙ

Иунихина О.В.

Иунихина Ольга Викторовна,
старший научный сотрудник, исполняющая обязанности заведующей лабораторией, кандидат медицинских наук

e-mail: olga_iun@inbox.ru

        Лаборатория природно-очаговых вирусных инфекций, созданная 01.04.2024 на базе лабораторий зоонозных инфекций и лаборатории природно-очаговых трансмиссивных инфекций, проводит научно-исследовательские (диагностические, экспериментальные, молекулярно-биологические, полевые) работы по изучению экологии и эпидемиологии возбудителей природно-очаговых инфекций 2 группы патогенности (арбовирусов, хантавирусов и др.).
        Лаборатория природно-очаговых трансмиссивных инфекций была организована в 1956 году Л. Г. Татариновой, защитившей в 1962 г. первую кандидатскую диссертацию по вирусолого-эпидемиологической характеристике природных очагов КЭ на территории Приморского края. C 1970 г. по 2024 г. лабораторию возглавляла д.м.н., профессор, заслуженный деятель науки РФ Леонова Г.Н. Под ее было выделено несколько новых для науки вирусов, создана коллекция возбудителей флавивирусных инфекций — Tick-borne encephalitis virus, Powassan virus, Khasan virus, Louping ill, Lyssavirus.
        Лаборатория зоонозных инфекций (прежнее название – лаборатория геморрагической лихорадки с почечным синдромом (ГЛПС) основана в 1980 г. д.м.н., профессором Слоновой Р.А. Под ее руководством в лаборатории проведены глубокие эколого-эпидемиологические исследования этой инфекции, установлены эпидемически значимые для региона генотипы хантавируса (Far East, Amur и Vladivostok) и их природные хозяева (Apodemus agrarius, Apodemus peninsulae, Rattus norvegicus), получены данные о клинических особенностях ГЛПС, ассоциированных с разными серотипами/генотипами хантавирусов, доказано наличие, наряду с классическими формами, легких, бессимптомных и атипичных форм хантавирусной инфекции.

Направления научных исследований

Природные очаги вирусных инфекций в Притихоокеанском ландшафтном поясе (в соответствии с Отраслевой программой Роспотребнадзора п. 2.1 «Эпидемиологический надзор, комплексный мониторинг природных очагов инфекций и их возбудителей, разработка средств и методов диагностики и профилактики заболеваний населения»)

Изучение популяционных характеристик возбудителей инфекционных заболеваний, их хозяев и переносчиков как факторов функционирования природного очага.
Изучение ландшафтно-климатических факторов, модулирующих функционирование природного очага.
Совершенствование методов лабораторной диагностики и профилактики природноочаговых вирусных заболеваний, а также индикации и идентификации их возбудителей. Разработка диагностических тест-систем для индикации новых вирусов, актуальных для российского Дальнего Востока.
Изучение антивирусной активности и механизмов действия биологически активных веществ из наземной и морской биоты Дальнего востока.
Совершенствование технологий эпидемиологического надзора и комплексного эколого-вирусологического мониторинга природных очагов вирусных инфекций в условиях Притихоокеанских ландшафтов; имплементация современных молекулярно-генетических, био- и геоинформационных методов исследований.
Моделирование функционирования природных очагов инфекционных заболеваний с целью прогнозирования их активности в зависимости от биотических и абиотических факторов.

Основные научные результаты (2021-2023 гг.)

        Разработан алгоритм систематического сбора полевого материала (эндемичных переносчиков трансмиссивных и зоонозных инфекций – иксодовых клещей, мышей) на территории юга российского Дальнего Востока. Выполнен анализ активности сочетанных природных очагов трансмиссивных клещевых инфекций в Дальневосточном федеральном округе (Приморском и Хабаровском краях, Еврейской автономной и Амурской областях и примыкающим эндемичным территориям Китая, Кореи, Японии. Проведен анализ инфицированности иксодовых клещей, снятых с людей на юге Дальневосточного региона в период 2017-2021 г.
        Установлена зараженность членистоногих переносчиков возбудителями клещевого энцефалита, боррелиоза, анаплазмоза, риккетсиоза, эрлихиоза с доминированием возбудителей бактериальной природы. Установлено ежегодное возрастание суммарного показателя инфицированности клещей, основной удельный вес которого приходится на B. Burgdorferi sensu lato.
        Верифицированы случаи лихорадки Денге, завезенные на территорию юга Дальнего Востока, установлены генотипы вируса. Детектировано наличие C. burnetii в иксодовых клещах, в сыворотках крови овец, лошадей.
        Завершена молекулярно-генетическая идентификация институтской коллекции штаммов ВКЭ дальневосточного генотипа (1956-2023); 74 штамма. Все исследуемые штаммы принадлежат к дальневосточному генотипу.
        В экспериментах in vitro, ex vivo и in vivo установлены механизмы защитного действия специфических антител по отношению к вирусу КЭ. Показано, что специфический IgG оказывает комплексное ингибирующее действие на ВКЭ, обладая как прямой нейтрализующей активностью на вирус, так и снижая его адсорбцию и внутриклеточную репликацию.
        Территория Приморского края ранжирована по уровню риска заражения возбудителем ГЛПС на основании эпидемиологических данных о заболеваемости в 2019-2021 г.
        Установлена иммуноадъювантная и иммуномодулирующая активность полисахаридов из морских бактерий в условиях нормы и иммуносупрессии, индуцированной дексаметазоном. Механизм иммуноадъювантного и иммуномодулирующего действия полисахаридов связан с усилением продукции Тh1 и Тh2 цитокинов, регенерацией иммунокомпетентных органов, восстановлением функциональной активности клеток врожденного иммунитета.
        Проведен сбор полевого материала в природных очагах инфекционных заболеваний, актуальных для Приморского края (182 особи мелких млекопитающих (Apodemus peninsulae, Apodemus agrarius, Myodes rufocanus, Microtus fortis, Rattus norvegicus), 3133 иксодовых клеща (Ixodes persulcatus — 1778, Ixodes pavlovskyi – 34, Haemaphysalis japonica –352, Haemaphysalis concinna – 848, Dermacentor silvarum — 121), 194 особи ночницы Брандта (Myotis brandtii), 186 диких птиц Освоен и внедрен в практику эколого-вирусологических исследований метод секвенирования вируса клещевого энцефалита и ортохантавируса по Сэнгеру. Выполнено секвенирование штаммов вируса клещевого энцефалита, изолированных из эндемичных переносчиков на территории юга Дальнего Востока – Primorye-4152, Primorye-4195, Primorye-472, Primorye-124, Primorye-4202, изолированных из клеща Ixodes persulcatus в 1977-1993 гг. По результатам полногеномного секвенирования РНК, выделенной из секционного материала (головной мозг пациента с клиническим диагнозом: бешенство природного типа, энцефалитическая форма) идентифицирован вирус Иркут (семейство Rhabdoviridae, род Lyssavirus). Охарактеризованы биологические свойства штамма, адаптированного к последовательному внутримышечному заражению суспензией головного мозга 3-х недельных лабораторных мышей.
        Установлена высокая численность и инфицированность ортохантавирусом Хантаан (Bunyavirales: Hantaviridae, Orthohantavirus) мышевидных грызунов, в том числе восточноазиатской мыши (Apodemus peninsulae) в лесных биотопах Владивостокской городской агломерации (32,9 на 100 л/н и 8,2 на 100 л/н).
        Установлен эпицентр природного очага лиссавируса Иркут, расположенный в лесных массивах, примыкающих к пойме р. Уссури на участке, ограниченном впадением рек Арсеньевка и Журавлёвка.
        Из мозга пациента, умершего от клещевого энцефалита, выделен и депонирован в коллекцию Института штамм вируса клещевого энцефалита (Amarillovirales: Flaviviridae, Flavivirus) Приморье_20_23.
        Установлена нуклеотидная последовательность гена E 21 штамма вируса клещевого энцефалита (Amarillovirales: Flaviviridae, Flavivirus) из коллекции Института, выделенных в Приморском крае в период 1977-2006 гг. (IIА, ФГБНУ «Научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.П.Сомова» Роспотребнадзора).
        Полученные результаты являются новыми, вносят вклад в понимание механизмов формирования штаммов возбудителей природно-очаговых инфекционных заболеваний с различными биологическими и молекулярно-генетическими характеристиками, и могут быть использованы для изучения их патогенного потенциала.
        Практическая значимость результатов определяется установлением современного генетического разнообразия возбудителей природно-очаговых инфекций, циркулирующих на юге Дальнего Востока.

Основные публикации (2019-2024 гг.)

Khotimchenko, Y.S., Shchelkanov, M.Y. Viruses of the Ocean: On the Shores of the Aqua Incognita. Horizons of Taxonomic Diversity // Russian Journal of Marine Biology. 2024;50(1):1-24. https://doi.org/10.1134/S106307402401005X
Leonova G.N., Somova L.M., Abramova S.A., Pustovalov E.V. Study of viral coinfection of the Ixodes persulcatus ticks feeding on humans in a natural focus of the south of the Far East // Microorganisms. 2023;11:1791. DOI: https://doi.org/10.3390/microorganisms11071791. WOS Q2
Yashina L.N., Hay J., Smetannikova N.A., Kushnareva T.V., Iunikhina O.V., Kompanets G.G. Hemorrhagic fever with renal syndrome in Vladivostok city, Russia // Frontiers in Public Health. 2021;9:620279. . DOI: https://doi.org/10.3389/fpubh.2021.620279. WOS Q2
Kompanets G., Kushnareva T., Iunikhina O., Guskova E., Pott A. New approaches to evaluation of relationship between epizootic and epidemic activity in the foci of co-circulation of different orthohantaviruses // International Journal of Infectious Diseases. 2019;79(S1):65. DOI: https://doi.org/10.1016/j.ijid.2018.11.167. WOS Q1
Леонова Г.Н. Влияние специфической профилактики на инфекционную активность вируса клещевого энцефалита (обзор собственных исследований) // Журнал инфектологии. 2022. 14. (1): 43-52. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2022-14-1-43-52
Леонова Г.Н., Шутикова А.Л., Попов А.Ф., Щелканов М.Ю. Верификация случая микст инфекции болезни Лайма, клещевого энцефалита и COVID-19. Acta biomedica scientifica. 2022; 7(5-2), 67-73: https://doi.org/10.29413/ABS.2022-7.5-2.7
Yashina L.N., Hay J., Smetannikova N.A., Kushnareva T.V., Iunikhina O.V., Kompanets G.G. Hemorrhagic Fever With Renal Syndrome in Vladivostok City, Russia // Frontiers in Public Health. 2021; 9:620279. https://doi.org/10.3389/fpubh.2021.620279
Иунихина О.В., Крылова Н.В., Мищенко Н.П., Васильева Е.А., Федореев С.А., Щелканов М.Ю. Сравнительное изучение in vitro антигерпетической активности эхинохрома А и продукта его окисления — дегидроэхинохрома // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2021; 171(4): 477-480. https://doi.org/10.47056/0365-9615-2021-171-4-477-480.
Лубова В.А., Шутикова А.Л., Бондаренко Е.И., Леонова Г.Н. Индикация Coxiella вurnetii на Дальнем Востоке России // Клиническая лабораторная диагностика. 2021; 66 (S4): 40.
Леонова Г.Н., Беликов С.И., Кондратов И.Г. Новые патогенные вирусы природных очагов Приморья, выделенные за 80-летнюю историю института (обзор вирусологических исследований) // Здоровье населения и среда обитания. 2021; 5(338): 26-32. https://doi.org/10.35627/2219-5238/2021-338-5-26-32.
Адельшин Р.В., Андаев Е.И., Леонова Г.Н. Анализ эффективности методов детекции вируса клещевого энцефалита в иксодовых клещах // Клиническая лабораторная диагностика. 2021;66(4): 237-241. http://dx.doi.org/10.51620/0869-2084-2021-66-4-237-241

Монографии

Чунихин С.П., Леонова Г.Н. «Экология и географическое распространение арбовирусов», М. « Медицина»- 1985 г.
Леонова Г.Н. «Клещевой энцефалит в Приморском крае» Владивосток, «Дальнаука» — 1997 г.
Леонова Г.Н., Павленко Е.В., Крылова Н.В. «Вакцинопрфилактика клещевого энцефалита», Владивосток: ОАО «Приморский полиграфкомбинат», 2006 г. – 100 с.
Леонова Г.Н. «Клещевой энцефалит: актуальные аспекты», М.: Издатель И.В.Балабанов, 2009 г. – 168 с.
Plekhova N.G., Somova L.M.. Lyapun I.N., Kondrashova N.M., Krylova N.V., Leonova G.N., Pustovalov E.V. The Cell of Innate Systems in Tick-borne Encephalitis. Flavivirus Encephalitis InTech October, 2011p. 167-194.
Leonova G.N. Evaluation of Immunological efficiency among patients vaccinated against Tick-borne Encephalitis Flavivirus Encephalitis. InTech October, 2011p. 195-212.
Somova Larisa M., Leonova Galina N., Plekhova Natalia G., Kaminsky Yurii V., Fisenko Anna Y.The Patomorphology of Far Eastern Tick-Borne Encephalitis Encephalitis InTech 2013, !13-144.
Leonova Galina N., Somova Larisa M.,. Belikov Sergeei I, Kondratov Ilya G., Plekhova Natalia G., Krilova Natalia V., Pavlenko Elena V., Tiunov Mikhail P., Tkachev Sergei. The Fatal Case of Lissavirus Encephalitis in the Russian Far East Encephalitis InTech 2013, 231-250.
Леонова Г.Н., Беседнова Н.Н. Вакцины против клещевого энцефалита. Национальное руководство «Вакцины и вакцинация» под редакцией В.В.Зверева, Р.М. Хаитова. 2014, с.387-400
Хантавирусы и хантавирусные инфекции (к 70-летию изучения ГЛПС на Дальнем Востоке России). Коллективная монография под редакцией д.м.н., профессора Р.А. Слоновой, к.м.н., доцента В.А. Иванис. Из-во ОАО «Примполиграфкомбинат», Владивосток, 2003 г. – 335 с.
Слонова Р.А., Ткаченко Е.А., Иванис В.А., Компанец Г.Г., Дзагурова Т.К. Геморрагическая лихорадка с почечным синдромом. Из-во ОАО «Примполиграфкомбинат», Владивосток, 2006 г. – 250 стр.
Слонова Р.А., Симонов С.Б., Компанец Г.Г., Симонова Т.Л., Кушнарева Т.В. и др. Хантавирусная инфекция в Приморском крае. Медико-географический атлас. Из-во ОАО «Примполиграфкомбинат», 2007 г.
Щелканов, М.Ю. Насекомые-эктопаразиты рукокрылых отряда / М.Ю. Щелканов, Т.В. Табакаева, Е.М. Щелканов, М.Р. Алиев, В.Ф. Толкач, Н.Н. Какарека, К.С. Масловский, Ю.Г. Волков, И.В. Галкина – Владивосток: Дальневосточный федеральный университет, 2022. – 242 с. DOI: 10.24866/7444-5404-3.
Щелканов, М.Ю. Рукокрылые: общая характеристика отряда / М.Ю. Щелканов, Е.Н. Любченко, И.П. Короткова, Е.М. Щелканов, Д.В. Панкратов, М.Н. Дунаева, А.Л. Суровый, Т.А. Кузнецова, А.В. Цыбульский, О.В. Иунихина, А.А. Кожушко, Ю.А. Белов, С.С. Уколов, Е.И. Дробот, Г.В. Иванчук, А.В. Табакаев, Р.А. Жилин, И.В. Галкина – Владивосток: Дальневосточный федеральный университет, 2021. – 130 с. DOI: 10.24866/7444-5119-6.
Щелканов, М.Ю. Биоэхолокация. Вопросы и задачи с ответами и решениями / М.Ю. Щелканов, Е.М. Щелканов, С.С. Уколов, Т.В. Табакаева, И.А. Баранчугов, А.Н. Воронова, Ю.А. Белов, О.М. Григорян, К.С. Вайнутис, Б.О. Щеглов, К.А. Баранчугова, И.В. Галкина – Владивосток: Дальневосточный федеральный университет, 2021. – 250 с. DOI: 10.24866/7444-5188-2.

Патенты

Патент RU 2 815 339 C1 «Набор олигонуклеотидов-праймеров, используемых для идентификации вируса болезни Ньюкасла» от 13.03.2024

Докторские диссертации

Леонова Г.Н. «Клещевые вирусные энцефалиты на юге Дальнего Востока»: М., 1992.
Беликов С.И. «Молекулярно-генетические подходы к изучению РНК-содержащих вирусов на моделях морбиливируса байкальской нерпы и вируса клещевого энцефалита». Дис.док.биол.наук. — Владивосток, 2000.
Крылова Н.В. Клеточные и молекулярные механизмы противовирусной защиты при клещевом энцефалите. – Москва, 2014.
Слонова Р.А. Геморрагическая лихорадка с почечным синдромом на юге Дальнего Востока России (вирусологические и эпидемиологические аспекты). М., 1993.
Симонов С.Б. Структурная организация сообществ грызунов и ее роль в поддержании очагов хантавирусной инфекции в Приморском крае. Владивосток, 2005.

Кандидатские диссертации

Татаринова Л.Г. «Характеристика очагов клещевого энцефалита в Приморском крае»: Л., 1962.
Беликова Н.П. «Биология клещей рода Haemaphysalis (H. japonica douglasi Nutt. et Warb., H. concinna Koch., H. neumanni D.) в Приморском крае»: Владивосток, 1969.
Леонова Г.Н. «Вирусы, выделенные из клещей в Приморском крае»: М., 1976.
Исачкова Л.М. «Патоморфология и патогенез экспериментальной инфекции, вызываемой вирусом Повассан (штамм Приморье-40)»: М., 1978.
Кругляк С.П. «Экология вируса Повассан»: Томск, 1985.
Лозовская С.А. «Эколого-вирусологическая характеристика очагов клещевого энцефалита Сихотэ-Алиня»: М., 1986.
Исаева М.П. «Молекулярно-генетическая характеристика популяции вируса клещевого энцефалита Южно-Сихотэ-Алиньского очагового региона»: Вдадивосток, 1998
Фисенко А.Ю. «Новые аспекты патологии дальневосточного клещевого энцефалита»: Владивосток, 2000 .
Борисевич В.Г. «Иммуно-вирусологические аспекты инаппарантной и стертой форм клещевого энцефалита»: Владивосток, 2002 .
Якушева С.С. «Иммунодиагностические особеннолсти клещевых инфекций в Приморском крае (клещевой энцефалит, иксодовые клещевые боррелиозы, клещевой риккетсиоз)»: Владивосток, 2002 .
Кулакова Н. В. «Молекулярно-генетическая характеристика дальневосточных штаммов вируса клещевого энцефалита, изолированных от людей с различными формами инфекционного процесса»: Владивосток, 2003 .
Павленко Е.В. «Характер противовирусного иммунитета к современным дальневосточным штаммам вируса клещевого энцефалита у лиц, привитых против этого заболевания»: Москва, 2008.
Романова Е.В. «Исследование геномов штаммов вируса клещевого энцефалита дальневосточного субтипа, выделенных от больных с разной тяжестью заболевания», Иркутск, 2010.
Косой М.Е.Эколого-эпидемиологическая характеристика природных очагов геморрагической лихорадки с почечным синдромом. М., 1987 г.
Компанец Г. Г. Распространение вируса Сеул на юге Дальнего Востока России и его роль в инфекционной патологии.- Владивосток, 2002.
Кушнарева Т.В. Гемагглютинирующие свойства хантавирусов и получение специфического диагностикума. Владивосток. 2002.
Боровская Н.А. Иммунологическая характеристика природных и антропоургических очагов лептоспироза на территории Приморского края в современных условиях. Владивосток. 2002.
Сокотун С.А. Иммунологическая и серотипическая характеристика природных очагов хантавирусной инфекции в Приморском крае. Владивосток. 2002.
Иунихина О.В. Вирусолого-эпизоотологическое обоснование воздушно-пылевого пути заражения хантавирусом. Москва, 2010.